neuroConstruct 1.6.0
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에 대해 neuroConstruct
neuroConstruct은 UCL에 신경 과학, 생리학 및 약리학의 부에 있는 실버 실험실에서 개발되고 있습니다. neuroConstruct생물학적으로 사실적인 뉴런의 복잡한 네트워크 개발, 즉 수지상 형태와 현실적인 세포막 전도도를 통합한 모델의 개발을 단순화하도록 설계되었습니다. Java에서 구현되며 개발 단계의 고급 단계에서 다른 시뮬레이션 플랫폼(PSICS, MOOSE 및 PyN을 포함)을 지원하여 NEURON 및 GENESIS 시뮬레이터용 스크립트 파일을 생성합니다. 그것은 최신 NeuroML 사양을 사용, 모프ML을 포함 하 여, 채널ML 및 NetworkML. 이 소프트웨어의 개발은 웰컴 트러스트, 의학 연구 위원회 및 EU 시냅스 프로젝트의 자금 으로 가능해졌습니다. neuroconstruct의 주요 기능 중 일부는 다음과 같습니다. * neuroConstruct은 단일 세포 또는 네트워크 모델에 포함하기 위해 제네시스, 뉴런, 신경 루시다, SWC 및 MorphML 형식으로 형태 파일을 가져올 수 있으며, 또는 더 많은 추상적 인 세포도 수동으로 구축 할 수 있습니다. * 3D에 위치 전도성 기반 뉴런의 네트워크의 생성 * 셀 그룹 간의 복잡한 연결 패턴을 네트워크에 지정할 수 있습니다. * 시뮬레이션 스크립트는 뉴런, 제네시스, MOOSE, PSICS 및 PyN 기반 시뮬레이터에 대해 생성 할 수 있습니다 (참고 : 모든 프로젝트가 모든 시뮬레이터에 대해 생성 될 수있는 것은 아닙니다). * 생물학적으로 사실적인 셀룰러 메커니즘(시냅스/채널 메커니즘)은 네이티브 스크립트 파일(*.mod 또는 *.g)에서 가져오거나 ChannelML을 사용하여 템플릿에서 만들 수 있습니다. * 시뮬레이션 데이터를 기록하는 코드의 자동 생성 및 neuroConstruct에서 데이터의 시각화 / 분석을 기록 * 기록 된 시뮬레이션 실행을 보고 시뮬레이션 브라우저 인터페이스를 통해 관리 할 수 있습니다 * 파이썬 기반 스크립팅 인터페이스를 사용하여 모델 생성 및 실행을 제어하여 셀 및 네트워크 모델 최적화를 위해 여러 시뮬레이션을 실행할 수 있습니다.