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HapSnap은 SNP 알레일 주파수에서 인간 인구에 있는 일반적인 haplotype을 계산합니다. 유전자형 기반 haplotype 추정에 비해 주요 장점은 분자 데이터 생성 및 계산 측면에서 속도입니다. 주요 단점은 정확도가 감소합니다.